1989 – 1990 Eğitim Öğretim yılında yapılan okulumuzun binası, 30 derslikten ibaret olup, 203 Erkek ve 107 Kızöğrenci ile 1990 – 1991 Eğitim Öğretim yılında hizmete başlamıştır. Açıldığında 1 Müdür ve 8 Öğretmen ile idari yapısını oluşturmuştur. Adını Osmanlı Sultanlarından İstanbul’u fetih eden Fatih Sultan Mehmet’ den almıştır.Halen 30 derslik ve idari odalardan oluşan aynı binada hizmet vermektedir. Toplam 8500 m2 alan üzerinekonuşlanmıştır.Okul binası 779 m2 dir.
Pendik İlçe Merkezine yaklaşık 3km mesafede bulunan okulumuza ulaşım sadece minibüslerle sağlanabilmektedir. Bulunduğu yer Pendik Dumlupınar mahallesinde olup bu mahallenin tek okuludur. Konumu itibari ile İstanbul’ un önemli sayfiye alanlarından Pendik Gözdağı mevkiinde bulunmaktadır. Şehrin gürültüsünden ve stresinden uzak bir mekandadır. Okulumuz 2005-2006 Eğitim ve Öğretim yılını güçlendirme kapsamında inşaata alındığından dolayı,komşu okulumuz Osmangazi İlköğretim okulunda tamamlamıştır.
